Inteligente y de buen corazón, Kubo se gana la vida como contador de historias. Un día, su existencia relativamente tranquila, se hace añicos al invocar accidentalmente a un espíritu que le pedirá tome revancha por una afrenta antigua. Junto a Monkey y Beetle formará su equipo y se embarcará en un jornada para salva a su familia y resolver el misterioso desaparecimiento de su padre, el más grande guerrero samurai que se haya conocido. Con la ayuda de su shaisen, un instrumento musical mágico, Kubo tendrá que enfrentarse a dioses y monstruos, incluyendo al vengativo Moon King y las malvadas mellizas para descifrar el secreto de su legado, reunir a su familia y cumplir con su heroico destino.
